نام (NAME)

obrotamer — تولید مختصات کنفورمر/روتامر

خلاصه دستور (SYNOPSIS)

obrotamer filename

توضیحات (DESCRIPTION)

ابزار obrotamer می‌تواند به عنوان بخشی از یک جستجوی صورت‌بندی با تولید ایزومرهای تصادفی بر اساس چرخش زاویه‌های دووجهی استفاده شود. این روتامرها کنفورمر نیستند — به این معنی که obrotamer پس از تولید ساختار روتامر، بهینه‌سازی هندسی انجام نمی‌دهد. ابزار obminimize می‌تواند بهینه‌سازی هندسی را با استفاده از مکانیک مولکولی انجام دهد.

محیط (ENVIRONMENT)

OB_RANDOM_SEED

دانه برای مولد اعداد شبه‌تصادفی؛ در صورت تنظیم نشدن یا خالی (null) بودن، از دانه تصادفی استفاده می‌شود. این ویژگی در صورتی کارآمد است که Open Babel با پرچم پیش‌پردازنده C یعنی -DOB_USE_OBRANDOMMT کامپایل شده باشد (هنگام انتشار نسخه ۴ به‌طور خودکار فعال خواهد شد).

مثال‌ها (EXAMPLES)

یک ایزومر چرخشی تصادفی از baseconformer.sdf تولید کرده و در rotamer1.sdf می‌نویسد.

همچنین ببینید (SEE ALSO)

obabel(1), obenergy(1), obfit(1), obgrep(1), obminimize(1), obrotate(1).

صفحات وب Open Babel را می‌توانید در نشانی زیر بیابید: https://openbabel.org

نویسندگان (AUTHORS)

پروژه Open Babel توسط گروه بزرگی توسعه داده می‌شود، از جمله نگهدارندگان فعلی: Geoff Hutchison, Chris Morley, Michael Banck, و افراد بی‌شمار دیگری که در رفع اشکالات و افزودن قابلیت‌ها مشارکت داشته‌اند. برای مشاهده مشارکت‌کنندگان بیشتر در Open Babel، پیوند زیر را ببینید: https://openbabel.org/docs/Introduction/thanks.html

کپی‌رایت و تکثیر (COPYRIGHT)

کپی‌رایت (C) 1998-2001 توسط OpenEye Scientific Software, Inc.
برخی بخش‌ها کپی‌رایت (C) 2001-2007 توسط Geoffrey R. Hutchison و سایر مشارکت‌کنندگان.

این برنامه یک نرم‌افزار آزاد است؛ شما می‌توانید آن را تحت شرایط «مجوز عمومی همگانی گنو» (GNU General Public License) همان‌گونه که توسط «بنیاد نرم‌افزارهای آزاد» منتشر شده است، نسخه ۲ مجوز، بازتوزیع نموده و/یا تغییر دهید.

این برنامه به این امید توزیع شده است که مفید باشد، اما بدون هرگونه ضمانت؛ حتی بدون ضمانت ضمنی قابلیت فروش یا مناسب بودن برای یک هدف خاص. برای جزئیات بیشتر «مجوز عمومی همگانی گنو» را ببینید.