OBROTAMER(1)             General Commands Manual (urm)            OBROTAMER(1)

<?><?><?> (NAME)
     obrotamer - <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?>/<?><?><?><?><?><?>

<?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> (SYNOPSIS)
     obrotamer filename

<?><?><?><?><?><?><?> (DESCRIPTION)
     <?><?><?><?><?> obrotamer <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?> <?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>
     <?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?>.  <?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> --
     <?><?> <?><?><?> <?><?><?><?> <?><?> obrotamer <?><?> <?><?>
     <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?>.  <?><?><?><?><?> obminimize
     <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?>.

<?><?><?><?> (ENVIRONMENT)
     OB_RANDOM_SEED
           <?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
           <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?>
           <?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?> (null)
           <?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>
           <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>.  <?><?><?>
           <?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?>
           <?><?> Open Babel <?><?> <?><?><?><?>
           <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> C <?><?><?><?>
           -DOB_USE_OBRANDOMMT <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?> <?><?><?><?>
           (<?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?>
           <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
           <?><?>).

<?><?><?><?><?><?><?> (EXAMPLES)
           obrotamer baseconformer.sdf > rotamer1.sdf

     <?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?>
     baseconformer.sdf <?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?> <?><?> rotamer1.sdf
     <?><?><?><?><?><?><?><?>.

<?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> (SEE ALSO)
     obabel(1), obenergy(1), obfit(1), obgrep(1), obminimize(1), obrotate(1).

     <?><?><?><?><?> <?><?> Open Babel <?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?> <?><?><?><?><?><?>:
     <https://openbabel.org>

<?><?><?><?><?><?><?><?><?> (AUTHORS)
     <?><?><?><?><?> Open Babel <?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?>: Geoff Hutchison, Chris
     Morley, Michael Banck, <?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?> <?><?> <?><?> <?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?> <?>
     <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?>.  <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?> Open
     Babel<?> <?><?><?><?><?> <?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?>:
     <https://openbabel.org/docs/Introduction/thanks.html>

<?><?><?><?><?><?><?><?> <?> <?><?><?><?><?> (COPYRIGHT)
     <?><?><?><?><?><?><?><?> (C) 1998-2001 <?><?><?><?> OpenEye Scientific
     Software, Inc.
     <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?> (C) 2001-2007
     <?><?><?><?> Geoffrey R. Hutchison <?> <?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?>.

     <?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?>
     <?><?> <?><?><?> <?><?><?><?><?> <<<?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?> <?><?><?>>> (GNU General Public License)
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?> <<<?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?>>> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?> <?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?>/<?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?>.

     <?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?> <?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?> <?><?><?> <?><?><?> <?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?>
     <?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?>
     <?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?> <?><?><?>
     <?><?><?>.  <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <<<?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?>>> <?><?>
     <?><?><?><?><?><?>.

Open Babel 3.2                   May 26, 2026                   Open Babel 3.2