OBSPECTROPHORE(1)        General Commands Manual (urm)       OBSPECTROPHORE(1)

<?><?><?> (NAME)
     obspectrophore - <?><?><?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?>

<?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> (SYNOPSIS)
     obspectrophore [OPTIONS] -i input_file

     obspectrophore [-u | -h]

<?><?><?><?><?><?><?> (DESCRIPTION)
     obspectrophore <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> (Spectrophores)
     <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?>.  <?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?>
     <?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>.
     <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?>
     <?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?>.
     <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?> <?> <?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?>
     <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?> <?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?>
     (chemoinformatics)<?> <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> (virtual
     screening) <?> <?><?><?><?><?><?><?><?> QSAR <?><?> <?><?><?>
     <?><?><?><?>.

<?><?><?><?><?><?><?><?> (OPTIONS)
     -i file
           <?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?> <?><?>
           <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?>
           <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?> <?><?>
           <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?>.  <?><?><?> <?><?><?><?> <?><?>
           <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?> <?><?><?><?><?>
           <?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>.

     -n value
           <?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?>
           <?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>.  <?><?><?><?><?><?>
           <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?> <?><?> (<?><?><?><?>
           <?><?><?><?><?><?><?>): No (<?><?><?><?><?><?><?>)<?> ZeroMean<?>
           UnitStd <?> ZeroMeanAndUnitStd.

     -a value
           <?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?> <?><?> <?><?><?><?>
           <?><?><?><?><?><?> <?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?>
           <?><?><?><?><?><?>.  <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>
           <?><?><?><?><?> <?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?>: 1 | 2 | 5 |
           10 | 15 | 20 (default) | 30 | 36 | 45 | 60

     -s value
           <?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?> (cages) <?><?> <?><?>
           <?><?><?><?> <?><?> <?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?>
           <?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?>
           <?><?><?><?><?><?>: P1 <?><?> P-1.  <?><?><?><?><?><?>
           <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?> <?><?> (<?><?><?><?>
           <?><?><?><?><?><?><?>): No (<?><?><?><?><?><?><?>)<?> Unique<?>
           Mirror <?> All.

     -r value
           <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> (resolution) <?><?><?><?>
           <?><?><?><?> <?><?> <?><?> <?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?>
           <?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>.
           <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?> 3.0 <?><?><?><?><?><?><?><?>
           <?><?><?>.  <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?>
           <?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?> <?><?> <?><?><?><?> <?><?><?>
           <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?>.

     -u    <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?>.

     -h    <?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>.

<?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> (SEE ALSO)
     obabel(1).

     <?><?><?><?><?> <?><?> Open Babel <?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?> <?><?>
     <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?>: <https://openbabel.org>

<?><?><?><?><?><?><?><?><?> (AUTHORS)
     <?><?><?><?><?> Open Babel <?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?>
     <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?>: Geoff
     Hutchison, Chris Morley, Michael Banck, <?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?> <?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?> <?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?>.  <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?> Open Babel
     <?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?>:
     <https://openbabel.org/docs/Introduction/thanks.html>

<?><?> <?><?><?> (COPYRIGHT)
     Copyright (C) 2005-2010 by Silicos NV

     <?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?>
     <?><?> <?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?> <?><?><?> (GNU General Public License)
     <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?> <?><?><?> (<?><?><?><?> <?> <?><?><?><?><?><?>)<?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?>/<?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?>.

     <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?>
     <?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> WO2009146735
     <?><?><?><?> <?><?><?><?>.  <?><?> <?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?>
     Silicos NV <?> <?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?>
     <?><?> <?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?> <?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?> <?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?>.

     <?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?> <?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?> <?><?><?> <?><?><?> <?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?>
     <?><?><?><?> <?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?>
     <?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?>
     <?><?><?><?> <?><?> <?><?><?> <?><?><?>.  <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?> <?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?>.

Open Babel 3.2                   May 26, 2026                   Open Babel 3.2