OBROTATE(1)              General Commands Manual (urm)             OBROTATE(1)

<?><?><?> (NAME)
     obrotate - <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?><?> SMARTS

<?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> (SYNOPSIS)
     obrotate SMARTS-pattern filename atom1 atom2 atom3 atom4 angle

<?><?><?><?><?><?><?> (DESCRIPTION)
     <?><?><?><?><?><?> obrotate <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     (<?><?><?><?><?><?> <?><?> dihedral) <?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?>
     <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?>.  <?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?> <?><?> <?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?>
     <?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?> <?><?>
     <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?> (<?><?><?><?> <?><?> <?><?><?>
     <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?> <?><?><?><?>).

     <?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?> SMARTS
     <?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?>
     <?> (<?><?><?>) <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>.  <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?>.
     <?><?> <?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?> atom1
     <?> atom4 <?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?> <?><?><?> <?><?><?><?>
     <?><?> <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?> atom2 <?>
     atom3 <?><?><?><?> <?><?><?><?><?>.

     <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?> --
     <?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?> atom1 <?> atom2
     <?><?><?><?> <?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?>
     <?><?><?><?> <?><?> <?><?> atom3 <?> atom4 <?><?><?><?><?> <?><?><?><?>
     <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>.

<?><?><?><?><?><?><?> (EXAMPLES)
     <?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?> (conformation) <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?> <?>- <?><?>
     <?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?> 3D-QSAR <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?>.

     <?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?> <?><?> <?><?><?><?>:
           obrotate 'c1ccncc1CCC' pyridines.sdf 5 6 7 8 90

     <?><?> <?><?><?><?><?> <?> <?> <?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?>
     <?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?> SMARTS (<?><?><?><?> c1-C) <?><?>
     <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?> <?> <?><?><?><?><?><?><?> <?> <?> <?>
     <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?>
     <?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?>.

     <?><?> <?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?>:
           obrotate 'c1ccncc1CCC' pyridines.sdf 4 6 7 8 90

     <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?> <?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?> <?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>:
           obrotate 'c1ccncc1CCC' pyridines.sdf 5 6 7 8 90

     <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?> <?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?> <?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?> <?><?>
     <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>:
           obrotate 'c1ccncc1CCC' pyridines.sdf 8 7 6 5 90

<?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> (SEE ALSO)
     obabel(1), obchiral(1), obfit(1), obgrep(1), obprop(1).

     <?><?><?><?><?> <?><?> Open Babel <?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?> <?><?>
     <?><?><?><?><?> <?><?><?>: <https://openbabel.org>

     <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?>
     SMARTS <?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?>:
     <https://www.daylight.com/dayhtml/doc/theory/theory.smarts.html>

<?><?><?><?><?><?><?><?><?> (AUTHORS)
     <?><?><?><?><?><?> obgrep <?><?><?><?> Fabien Fontaine <?><?><?><?><?>
     <?><?><?> <?><?><?>.

     <?><?><?><?><?> Open Babel <?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?>
     <?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?>:
     Geoff Hutchison, Chris Morley, Michael Banck, <?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?> <?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?> <?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?>.  <?><?><?><?>
     <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?> Open Babel<?> <?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?>:
     <https://openbabel.org/docs/Introduction/thanks.html>

<?><?><?><?><?><?><?><?> <?> <?><?><?><?><?> (COPYRIGHT)
     <?><?> <?><?><?> (C) <?><?><?><?>-<?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?>
     OpenEye Scientific Software, Inc.
     <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?> (C)
     <?><?><?><?>-<?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?> Geoffrey R. Hutchison
     <?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?>.

     <?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?> <?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?>
     <?><?> <?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?> <?><?><?> (GNU General Public License)
     <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?> <?><?><?> (<?><?><?><?> <?> <?><?><?><?><?><?>)<?>
     <?><?><?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?><?>.

     <?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?> <?><?><?> <?><?><?><?>
     <?><?><?><?><?> <?><?><?> <?><?><?> <?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?>
     <?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?>
     <?><?><?><?> <?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?><?><?> <?><?>
     <?><?><?> <?><?><?>.  <?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?>
     <?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?> <?><?><?><?><?><?> <?><?><?>
     <?><?><?><?><?><?> <?><?><?><?>.

Open Babel 3.2                   May 26, 2026                   Open Babel 3.2