.Dd May 26, 2026
.Dt OBGEN 1 URM
.Os "Open Babel" 3.2
.Sh "نام (NAME)"
.Nm obgen
.Nd "تولید مختصات سه‌بعدی برای یک مولکول"
.Sh "خلاصه دستور (SYNOPSIS)"
.Nm
.Op Ar OPTIONS
.Ar filename
.Sh "توضیحات (DESCRIPTION)"
ابزار
.Nm
مختصات سه‌بعدی را برای مولکول‌های موجود در یک فایل (مانند فایل‌های چندمولکولی SMILES) تولید می‌کند.
ساختار حاصل با استفاده از میدان نیروی مشخص‌شده بهینه‌سازی می‌شود و با استفاده از جستجوی مونت‌کارلو برای یافتن کنفورمر با کمترین انرژی بررسی می‌گردد.
خروجی با فرمت فایل SDF به خروجی استاندارد ارسال خواهد شد.
.Sh "گزینه‌ها (OPTIONS)"
اگر نام فایلی داده نشود،
.Nm
تمامی گزینه‌ها شامل میدان‌های نیروی موجود را نمایش می‌دهد.
.Bl -tag -width flag
.It Fl ff Ar forcefield
انتخاب میدان نیرو
.El
.Sh "محیط (ENVIRONMENT)"
.Bl -tag -width flag
.It Ev OB_RANDOM_SEED
هسته (seed) برای مولد اعداد شبه‌تصادفی؛ در صورت تنظیم نشدن یا خالی بودن، از هسته تصادفی استفاده می‌شود.
این ویژگی در صورتی مؤثر است که Open Babel با پرچم پیش‌پردازنده \fI-DOB_USE_OBRANDOMMT\fP کامپایل شده باشد (هنگام انتشار نسخه ۴ به طور خودکار فعال خواهد شد).
.El
.Sh "مثال‌ها (EXAMPLES)"
مشاهده گزینه‌های ممکن، شامل میدان‌های نیروی موجود:
.Dl "obgen"
.Pp
تولید مختصات سه‌بعدی برای مولکول(ها) در فایل test.smi:
.Dl "obgen test.smi"
.Pp
تولید مختصات سه‌بعدی برای مولکول(ها) در فایل test.smi با استفاده از میدان نیروی UFF:
.Dl "obgen -ff UFF test.smi"
.Sh "همچنین ببینید (SEE ALSO)"
.Xr obabel 1 ,
.Xr obconformer 1 ,
.Xr obminimize 1 .
.Pp
صفحات وب Open Babel را می‌توانید در نشانی زیر بیابید:
\%<\fBhttps://openbabel.org\fR>
.Pp
صفحات وب مربوط به مکانیک مولکولی Open Babel در نشانی زیر در دسترس است:
\%<\fBhttps://openbabel.org/docs/Forcefields/Overview.html\fR>
.Sh "نویسندگان (AUTHORS)"
برنامه obgen توسط
.An Tim Vandermeersch
ارائه شده است.
.Pp
.An -nosplit
پروژه Open Babel توسط افراد بسیاری توسعه یافته است، از جمله نگه‌دارندگان فعلی:
.An Geoff Hutchison ,
.An Chris Morley ,
.An Michael Banck ,
و افراد بی‌شمار دیگری که در رفع اشکالات و افزودن امکانات مشارکت داشته‌اند.
برای مشاهده مشارکت‌کنندگان بیشتر Open Babel، ببینید:
\%<\fBhttps://openbabel.org/docs/Introduction/thanks.html\fR>
.Sh "حق نشر (COPYRIGHT)"
حق نشر (C) 2007\-2008 متعلق به Tim Vandermeersch.
.Pp
این برنامه یک نرم‌افزار آزاد است؛ شما می‌توانید آن را تحت شرایط «مجوز عمومی همگانی گنو» (GNU General Public License) همان‌طور که توسط بنیاد نرم‌افزار آزاد منتشر شده است (نسخه ۲ مجوز)، بازتوزیع کرده و/یا تغییر دهید.
.Pp
این برنامه با این امید توزیع شده است که مفید باشد، اما بدون هرگونه ضمانت؛ حتی بدون ضمانت ضمنی قابلیت فروش یا مناسب بودن برای یک هدف خاص.
برای جزئیات بیشتر به «مجوز عمومی همگانی گنو» مراجعه کنید.