نام (NAME)

obconformer — تولید مختصات کنفورمر

خلاصه دستور (SYNOPSIS)

obconformer #-of-conformers #-of-optimization-steps filename [forcefield]

توضیحات (DESCRIPTION)

ابزار obconformer می‌تواند به عنوان بخشی از یک مطالعه‌ی کنفورماسیونی، با تولید کنفورمرهای تصادفی با استفاده از جستجوی مونت‌کارلو (Monte Carlo) به کار رود. پس از اعمال تعداد گام‌های مشخص‌شده برای بهینه‌سازی هندسی، بهترین کنفورمر از میان دسته‌ی کنفورمرها در خروجی قرار خواهد گرفت. به طور پیش‌فرض، obconformer از میدان نیروی MMFF94 استفاده می‌کند.

مثال‌ها (EXAMPLES)

obconformer 250 100 baseconformer.sdf
  > rotamer1.sdf

تولید بهترین کنفورمر (از میان ۲۵۰ مورد) فایل baseconformer.sdf و نوشتن آن در rotamer1.sdf پس از ۱۰۰ گام بهینه‌سازی هندسی.

همچنین ببینید (SEE ALSO)

obabel(1), obenergy(1), obfit(1), obgrep(1), obminimize(1), obrotate(1).

صفحات وب Open Babel را می‌توانید در نشانی زیر بیابید: https://openbabel.org

نویسندگان (AUTHORS)

پروژه Open Babel توسط افراد بسیاری توسعه یافته است، از جمله نگهدارندگان کنونی: Geoff Hutchison, Chris Morley, Michael Banck, و افراد بی‌شمار دیگری که با ارسال اصلاحات و قابلیت‌های جدید مشارکت داشته‌اند. برای مشاهده مشارکت‌کنندگان بیشتر در Open Babel، به نشانی زیر مراجعه کنید: https://openbabel.org/docs/Introduction/thanks.html

کپی‌رایت و تکثیر (COPYRIGHT)

حق نشر (C) ۱۹۹۸-۲۰۰۱ متعلق به OpenEye Scientific Software, Inc.
برخی از بخش‌ها حق نشر (C) ۲۰۰۱-۲۰۰۸ متعلق به Geoffrey R. Hutchison و سایر مشارکت‌کنندگان است.

این برنامه یک نرم‌افزار آزاد است؛ شما می‌توانید آن را تحت شرایط «مجوز عمومی همگانی گنو» (GNU General Public License) نسخه ۲ که توسط بنیاد نرم‌افزارهای آزاد (Free Software Foundation) منتشر شده است، بازتوزیع کرده یا تغییر دهید.

این برنامه با این امید توزیع شده است که مفید واقع شود، اما بدون هرگونه ضمانت؛ حتی بدون ضمانت ضمنی «قابل فروش بودن» یا «مناسب بودن برای یک هدف خاص». برای جزئیات بیشتر، متن کامل «مجوز عمومی همگانی گنو» را مطالعه کنید.